De prime abord, et sauf contre-indication express formulé par une personne qui s'y connaîtrait plus que moi, il n'y a pas de contre-indication.
L'intensité de charge (ou de recharge, plutôt) sera plus faible, donc le temps sera plus long, mais ne nuira en rien aux batteries.
Normalement, dans le chargeur, ce n'est pas la capacité qui intervient (Sauf à limiter l'intensité), mais un truc que l'on nomme delta T sur Delta V.
C'est à dire une rupture dans l'accroissement de tension.
Mathématiquement parlant, c'est la pente de la dérivé qui brutalement, change.
Cela n'intervient qu'en fonction de la tension (et du temps).